cNx SUITE (Chenomx NMR Suite)
NMRデータを用いた代謝物同定/定量解析
cNx SUITE は、血液や尿といった各種化合物が複雑に混ざり合っている生体サンプルを用いたNMRスペクトルから、生体内の代謝影響における “安全性・毒性” や “生体状態のメカニズム” を解析する上で重要な、代謝物の同定と定量解析を行う総合プラットフォームです。Chenomxが提供している約330種類の代謝化合物を含む化合物ライブラリやユーザー独自の化合物ライブラリを使うことで、正確な処理・確実な同定・そしてNMRスペクトル内の代謝物の定量が可能です。これにより、「新薬研究」及び「疾患検出」のための極めて有用なツールとなります。
cNx SUITE は、5つのモジュールから構成されています。
cNx SUITE (Chenomx NMR Suite)について
Processor
各種フォーマットの1D-NMRデータ処理を行うツールです。FIDの読込みから、ウィンドウ関数・FT・ベースライン補正・位相補正などを行い、Profilerで解析可能なデータへと変換します。
右図：Processor画面
※ 読込み可能なフォーマット
VNMR、XWIN-NMR、Delta、NMR Pipe、JCAMP-DX
（その他フォーマットにつきましては、別途お問合せください）
※ データ処理機能一覧
ウィンドウ関数、ゼロフィリング、フーリエ変換、水溶媒削除、ベースライン補正、位相補正、レファレンスデコンボリューション、処理履歴表示機能 など
Profiler
Processorで処理したNMRスペクトルデータから個々の化合物を同定し、その化合物濃度を用いた定量化を行うツールです。500MHz・ 600MHz・700MHz・800MHzで測定された約330種類の化合物ライブラリ及び、400MHzで測定された197種類の化合物ライブラリ、低周波を含む12種類のSimulated Reference化合物ライブラリが準備されており、このライブラリを用いて同定を行います。また、HMDBライブラリも別途利用することが可能です。 また、同定/定量に関しては受託サービスもお請けしております。受託に関しては別途お問い合わせください。Profilerでは4種類の解析手法を備えています。
右図：Profiler画面、Targeted Profilingと化合物表示例
Targeted Profiling
Chenomxライブラリを用いて代謝物を同定/定量し、代謝物と濃度リストが作成される
類似した複数のスペクトルに対して同定/定量を行うための、バッチ機能も可能
Spectral Binning
スペクトルをBinning（バケット積分）し、積分値とピークエリアリストが作成される
Targeted Binning
単なるBinningではなく、Chenomxライブラリを用いて、各代謝物毎の積分を実施。代謝物と積分値リストが作成される
Residual Binning
Targeted Profilingで同定できなかったスペクトルに対してのみBinningを実行する
※ 統計解析ソフトとの連携
Profilerの種類の解析手法で作成された各結果リストは、SIMCA/Excelフォーマットへの出力が可能で、統計ソフトにおいて更に解析を行うこともできます。例えば、UmetricsのSIMCAプログラムで解析する場合には、PCA（主成分分析）・PLS-DA/(O/O2)PLS-DA（判別分析）を実行することで、各種マーカー候補の特定が出来、更にはSIMCA法を用いてグループの識別（例：疾患と健常、性差、投与差など）も可能です。
※ 外部データベースへのリンク
ライブラリ内の各化合物は、PubChemを初め、ChEBI、eMolecules、HMDBへのリンク機能がついています。（インターネット接続可能なPCのみ）これにより、代謝化合物の詳細情報の確認をすることが出来ます。
Spin Simulator
ライブラリ内に含まれていない新規化合物をライブラリに登録するための、1次シミュレーションツールです。スピン情報の定義やスピンースピンカップリング情報を用いた、より効果の高いシミュレーションが可能です。
Compound Builder
Spin Simulatorで作成した理論的なモデルから、総合的なクラスターをフィッティングさせる機能を持つツールです。化合物のフルアサインやカップリング情報の全てを解読する必要はなく、容易に新規化合物をライブラリに登録することが可能です。
Library Manager
Profiler内で使う化合物ライブラリを設定・構築するツールです。独自のミニライブラリの作成や、ライブラリに含まれていない新規化合物の登録なども可能です。
右図：Library Manager画面
cNx SUITE で利用可能なNMR ライブラリ
- 1H-NMRライブラリ（Chenomx社ライブラリ）
400・500・600・700・800MHzで測定された約330種類の化合物ライブラリ
cNx SUITE Reference Libraries 400 Mhz – 700 Mhz Excel Document
60・80・90・100・125・300MHzのSimulated Reference化合物ライブラリ
- その他ライブラリ
University of Albertaの1H-NMR HMDB レファレンスライブラリ（400～1200MHｚ対応）
University of Calgaryの13C-NMRレファレンスライブラリ（600MHz・700MHz）
稼働環境
OS（64bit）: Windows 10/11、MacOS X(Big Sur-to-Tahoe)、Linux x86_64
メモリ：8GB以上推奨
ディスク容量：250MB以上推奨
関連サービス・製品情報
Chenomx の受託サービスのご案内（オプション）
- Targeted Analysis サービス
1H-NMRスペクトル（もしくはFID）をお送り頂き、ライブラリ同定/定量を行うサービスです。最低10スペクトルからお請けしております。
＊受託サービスの詳細に関しては、別途お問い合わせください。
BENCHTOP Pro New Product
- 低周波Simulatedライブラリに特化した新製品「BENCHTOP Pro」リリース
5種類の低周波（60MHz,80MHz,90MHz,100MHz,125MHz）Simulatedライブラリのみを搭載した新製品がリリースされました。
ライブラリ種類以外はcNx SUITEと同機能です。
※記載の商品名等は各社の登録商標、または商品の場合があります。
