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PEAKS AB

モノクローナル抗体解析サービス

#モノクローナル抗体 #タンパク質配列 #翻訳後修飾 #受託 #アミノ酸配列

PEAKS ABサービスは、ユーザーが提供したモノクローナル抗体(mAb)サンプルから、正確なタンパク質配列と、関連する翻訳後修飾(PTM)を提供する専門的なサービスで、サンプル調整・高分解能LC-MS/MS測定・データ解析・レポーティングまでをカバーしています。
データ解析には、カナダBSI社が開発した、モノクローナル抗体の配列を決定する独自のde novoシーケンシングテクニックを有する「PEAKS ABソフトウェア」を使います。この、PEAKS ABサービスは、アイソタイプやアロタイプなど全種類のheavy & light chainの抗体配列に対応しています。

PEAKS ABについて

サービスタイプ

サービス内容は以下の通りです。
① サンプル調整
② 高分解能LC-MS/MS測定
③ データ解析
※必要なサンプル条件
- Sample size : 0.2mg以上
- Purity : 95%以上※ご希望の方には残サンプルの返却も可能です。

 

PEAKS ABサービスの特徴

① 100% Sequence Coverage & Accuracy

各アミノ酸が20個以上のペプチドとマッピングされることを保証しています。PEAKS ABソフトウェアを用いた右図のマッピング例では、peptide-spectrumレベルで0.1%のFDRが得られています。
また、このサービスではde novoシーケンシング結果に基づいてアミノ酸レベルでクオリティコントロールを実施しています。MS/MSデータから得られるダイレクトなフラグメントイオン情報は、アセンブルされたタンパク質配列中の各アミノ酸にリンクしています。

② Leucine & Isoleucine Differentiation

酵素切断プレファレンス及びホモロジーデータベース統計に基づいて、ロイシンとイソロイシン残基を区別することができます。

③ Modification Analysis

翻訳後修飾(PTMs)及び配列変異体に関する定性・定量分析をご提供します。

④ わかりやすいレポート

PEAKS ABサービスでは、以下のような結果をお客様にお渡しします。
- Experimental Procedure
- Protein Sequence
- Homology Alignment
※実際のレポートはサービス内容に応じて変動します。

 

 

参考文献

① Shan, B. and Xin, L. Integrating de novo Sequencing and Database Search for Monoclonal Antibody Sequencing. J Biomol Tech. 24(Suppl). S62?S63. 1/5/2013.

② Tran, N.H. et al. Complete De Novo Assembly of Monoclonal Antibody Sequences. Scientific Reports. 6:31730. 26/08/2016.

 

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