ライフサイエンスニュースレター vol.2
インフォコムではライフサイエンス関連の注目論文をメールにてお届けしております。本コラムでは過去に配信したニュースレターを掲載いたします。最新版のメール配信をご希望される方はお問い合わせフォームからご用命ください。
INDEX
抗SARS-CoV-2薬商用ライブラリーを対象にしたスクリーニングと評価
Title
Commercial SARS-CoV-2 Targeted, Protease Inhibitor Focused and Protein–Protein Interaction Inhibitor Focused Molecular Libraries for Virtual Screening and Drug Design
各社から提供されている市販のSARS-CoV-2標的およびプロテアーゼ阻害剤標的またはタンパク質-タンパク質相互作用阻害剤標的化合物ライブラリーのコレクションを対象にしてバーチャルスクリーニングを行い、ライブラリーの評価を行っている報告です。
PAINS、REOS、Lipinski Ro5を用いたライブラリーのフィルタリングならびに結果の可視化のためにKNIMEが利用されています。
胃酸分泌抑制剤の薬物相互作用に関するシステマティックレビュー
Title
A Systematic Review of Gastric Acid-Reducing Agent-Mediated Drug–Drug Interactions with Orally Administered Medications
胃酸分泌抑制剤の薬物間相互作用（DDI）をレビューは発表されていますが、胃酸低減剤（ARAs）とのDDIを十分に網羅したものではなく、胃pH依存性のDDIや基礎的医薬品に焦点を当てる傾向にあります。本論文では、ARAとの間で有効性の低下や副作用を含む臨床的に意義のあるDDIを有する経口薬を包括的に同定し、相互作用のメカニズムに従って薬を分類する事を目的としたシステマティックレビューを報告します。
薬剤の検索ならびにシステマティックレビューのソースとしてDIDBが用いられています。
記述子を用いない長短期記憶ニューラルネットワークによるQSARモデリング
Title
Descriptor Free QSAR Modeling Using Deep Learning With Long Short-Term Memory Neural Networks
現在QSARモデル構築は、トレーニングセット化合物の記述子を計算しアルゴリズムを適用後、統計的フィッティング法を用いてモデルを構築しています。本研究では、大規模かつ多様なデータセットに対して事前に計算された記述子を用いずに、解釈可能なQSARを構築する可能性を検討しました。
CASE UltraおよびMETA Ultraを開発しているMultiCASE Inc.スタッフが本論文の著者となっています。
ミネラルオイルおよびワックスの経皮浸透性に関する包括的な文献検索
Title
Review of data on the dermal penetration of mineral oils and waxes used in cosmetic applications
化粧品に使用されるミネラルオイルとワックスは、皮膚への耐性に優れ、高い保護や洗浄効果を持つことから、スキンケアやリップケアの化粧品に使用される一方、化粧品の経皮使用によるミネラルオイルやワックスの健康への悪影響が懸念されてきています。この調査のために、包括的な文献検索が行われました。13のin vivo（ヒト、動物）及びin vitroの研究報告を分析しミネラルオイルとワックスが経皮吸収され、全身に行き渡るという証拠がないことから消費者の健康に対するリスクはないと結論付けされました。
文献収集のツールの1つとしてToxplanetが用いられました。
関連製品のご紹介
・ワークフロー型データ分析プラットフォーム『KNIME』
・毒性情報検索システム『ToxPlanet』
・毒性予測ソフトウェア『CASE Ultra』
・代謝物予測ソフトウェア『META Ultra』
